这项研究介绍了一套名为 Deep-STARmap 和 Deep-RIBOmap 的 3D 原位分析平台,旨在解决传统薄切片在组织变形、人工劳动和转录组数据不完整方面的局限。该技术利用 水凝胶重嵌入 和 光化学交联 等创新手段,实现了对厚组织样本中单细胞转录组和翻译组的高精度成像。在应用中,研究人员通过对 小鼠大脑 的分析,成功揭示了神经元分子亚型与其树突形态之间的紧密联系。此外,该平台还被应用于分析 人类皮肤癌 样本,能够精准区分肿瘤细胞与免疫细胞,并量化三维空间内的细胞邻近关系与相互作用。这种方法不仅为 三维空间组学 提供了可扩展的框架,也为深入理解复杂疾病的组织微环境开辟了新路径。
References:
- Sui X, Lo J A, Luo S, et al. Scalable spatial single-cell transcriptomics and translatomics in 3D thick tissue blocks[J]. Nature Methods, 2025: 1-11.
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