431-CellRank：单细胞命运映射的有向轨迹推断

该研究介绍了一种名为 CellRank 的计算框架，旨在通过单细胞数据分析预测细胞的 分化命运。研究人员利用该工具分析了小鼠胰腺和肺部组织的再生过程，成功识别出调节 delta 细胞 形成的新型基因。在肺部研究中，该模型揭示了一条从 杯状细胞 回溯到 基底干细胞 的非典型 去分化 路径。这一预测通过免疫荧光实验得到了验证，证明在组织受损后确实存在特定阶段的中间细胞。此外，文档详细阐述了该算法背后的 马尔可夫链 数学原理及不确定性传播的处理方法。总体而言，该方法为探索复杂生物系统中的细胞 谱系演变 提供了强有力的分析手段。

References:

• Lange, M., Bergen, V., Klein, M. et al. CellRank for directed single-cell fate mapping. Nat Methods 19, 159–170 (2022). doi.org