TEDD 2.0 是一个升级版的发育过程时间基因表达数据库,旨在通过先进的原位生物信息学分析探索发育机制。该平台整合了来自 9 个物种的 1500 万个单细胞数据,涵盖 85 种组织类型及 162 个发育时间点。核心更新包括虚拟基因敲除模块以预测基因扰动影响,以及跨物种整合工具来识别演化中的保守性。此外,数据库还集成了谱系轨迹推断和标志基因识别功能,帮助科研人员揭示细胞命运决定的动态过程。通过提供云端计算资源和易用的交互界面,该资源显著降低了处理复杂发育转录组数据的技术门槛。这一综合性平台为深入理解生物体从胚胎到成年阶段的基因时空调控提供了强有力的支持。
References:
- Chan C C, Lam K K, Chen L, et al. TEDD 2.0: an advanced temporal gene expression database enabled by in-silico functional analyses for developmental mechanism investigation[J]. Science China Life Sciences, 2025: 1-15.
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