792-Spateo：三维全胚胎时空组学建模框架

本文介绍了一个名为 Spateo 的三维空间转录组学建模框架，旨在通过分子全息图还原胚胎发育的复杂过程。该工具解决了大规模三维数据集在对齐、数字化分析以及细胞间通讯模拟方面的技术难题，能够精确重建包含数百万细胞的小鼠和果蝇胚胎模型。研究人员利用 Spateo 揭示了中枢神经系统组织者的信号转导图谱，并定义了描述细胞迁移的形态向量场。通过结合微分几何定量分析，该研究成功将宏观的器官形态变化与微观的基因调控动力学联系起来。此外，配套的 Spateo-viewer 交互式平台为科研人员探索三维空间基因表达提供了直观的视觉化手段。

References:

• Qiu X, Zhu D Y, Lu Y, et al. Spatiotemporal modeling of molecular holograms[J]. Cell, 2024, 187(26): 7351-7373. e61.