268-PROGENy：推断通路活性的基因表达签名

这篇文章介绍了一种名为 PROGENy 的新方法，旨在通过分析基因表达来推断细胞信号通路活动，这对癌症研究和药物开发至关重要。研究人员指出，传统的途径映射方法忽略了翻译后修饰的影响，而 PROGENy 通过整合大量公开的扰动实验数据，识别出了一组稳定的“通路响应基因”（Pathway RespOnsive GENes）。该方法在恢复已知驱动突变的影响、提供药物适应症的有力标记以及区分致癌和抑癌通路方面表现出优于现有方法的性能，并被证明能更准确地推断出各种条件下的通路活动，对患者生存预测和药物反应预测具有重要意义。

References:

• Schubert M, Klinger B, Klünemann M, et al. Perturbation-response genes reveal signaling footprints in cancer gene expression[J]. Nature communications, 2018, 9(1): 20.