这篇文章介绍了一种名为压缩 Perturb-seq的新型基因筛选技术,它通过减少实验成本和规模来提高传统的 Perturb-seq 方法的效率。这种新方法通过两种实验策略实现压缩:细胞池化(将多个细胞放入一个液滴中)和向导池化(在单个细胞内引入多个向导 RNA),并结合 FR-Perturb 推理算法来计算性地解压测量结果,从而准确推断基因扰动效应。研究人员在人类巨噬细胞系中应用此技术对 598 个免疫相关基因进行了测试,证实了压缩 Perturb-seq 能够高效地识别免疫反应的关键调控因子,并能够提高发现遗传相互作用的能力。此外,研究还利用这些扰动数据,揭示了与人类疾病(如炎症和血液性状)遗传力相关的基因,但指出其结果与群体遗传学研究中发现的反式表达定量性状位点(trans-eQTLs)之间缺乏一致性。
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* Yao D, Binan L, Bezney J, e...去小宇宙查看完整单集简介
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