900-Orthrus：进化与功能指导下的RNA基础模型

这篇论文介绍了 Orthrus，一个基于 Mamba 架构的成熟 RNA 基础模型，旨在通过学习演化与功能特征来预测转录本的生物属性。该模型采用了对比学习预训练方法，通过最大化剪接异构体及跨物种同源序列之间的相似性，有效地捕捉了功能保守的基因组特征。研究表明，Orthrus 在预测 mRNA 半衰期、核糖体载量和亚细胞定位等任务中达到了顶尖水平。即便在标注数据极少的少样本场景下，它依然展现出卓越的性能，大幅领先于参数量更多的现有模型。此外，该模型能够通过潜在空间聚类区分不同异构体的功能差异，为理解复杂的 RNA 调控机制提供了强有力的计算工具。
References:
* Fradkin P, Shi R I, Dalal T, et al. Orthrus: toward evolutionary and functional RNA foundation models[J]. Natu...去小宇宙查看完整单集简介
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